蝸牛標本記錄的簡單資料分析

蝸牛標本記錄的簡單資料分析

蝸牛標本記錄的簡單資料分析，以琉球大學線上標本資料庫為例。



從網頁資料頁面初步解析:算是有系統的在收集琉球群島(奄美到八重山)的各類群生物。


美中不足的是沒有標本照片和詳細地點，也沒有留組織樣本。
1.物種判斷可能會隨著分類變更而有誤。(如果去檢視標本可以。)
2.無法進一步作為需要更精確尺度的空間生態分析的資料。但因為琉球群島的海拔不高，所以比較不會有海拔帶不同物種的問題。
3.無法做繁殖季的分析。(如果去檢視標本可以。)
4.無法作為遺傳分類材料。(如果保存狀況不佳也無法。)

想要回答的問題:
1.這份清單有幾科幾種。
2.各科有幾種，前幾大科為何?
3.地點特徵。行政區、地點數、每個地點的資料筆數。
4.年份、月份的特徵。


資料來源:


琉球大學博物館楓樹館Ryukyu University Museum, Fujukan

http://fujukan.lib.u-ryukyu.ac.jp/db_database/lib_main.php?type=1





步驟0:
將網站的線上資料庫整理成excel表格。技術可行也可以爬蟲資料。


開始:
一、科別統計1
1.將科別欄位複製到新的表單。
2.可複製二次，第一欄使用資料→移除重複，建立只有科別列表的表單。這一部除了統計科的數量，在接下來計算各科的資料筆數也會用到這欄資料。這裡可以回答這份資料總共記錄22個科。
3.統計各科的資料筆數。使用countif(E$1:E$119,family)，之後就可以下拉計算其他科。$是為了固定選取資料範圍。
4.接著排序各科資料筆數的大小。資料→排序。排序對象:數值，順序:由小到大或由大到小皆可。(在排序之前請先將複製貼上的資料在旁邊空白欄位，再複製貼上數值欄一次以清除運算公式，不然排序後的數值會跑掉。後面的各步驟都要注意這點。)
圓餅圖的版面有限，因為科數有點多，後面5%以下的科可以集中在others。但是圖表資料範圍選取就要從後面開始。

二、科別統計2
1.將物種名(species)欄位清單複製一次，移除重複。發現物種清單只少了5筆資料，顯示這是有系統在蒐集物種。這邊可以回答這份資料總共記錄114個物種(亞種)。

三、地點統計1
各地區的資料筆數，通常隨機調查資料越遠離人口密集的都市資料越少，僅剩觀光景點的點狀記錄。另外通常一個地點會有多筆調查記錄。
1.地點資料原本只有一個欄位。我們已經先衣料行政區界和地點，區分出:縣市(county)、鄉鎮區(downtown)(在此因為蝸牛的生物特性用島嶼island來區分)、地名(location)
2.跟前項一樣，複製資料欄位，移除重複，建立地名清單，countif函數統計。
這裡可以回答:分屬沖繩縣98筆和鹿兒島縣21筆資料，分屬在14個島，55個地點，接著再排序各島和各地點的資料筆數。最多的依序為(>10筆):沖繩島、宮古島、奄美島、石垣島。地點大部分只有1、2筆記錄，最多8筆。


四、地點統計2
1.進一步想探討各島的調查地點數。通常記錄越多的島(或行政區)，調查地點越多。步驟:開一個新的地點統計2表單。將地點資訊複製過來，以地點(location)移除重複，就會得到55個地點。2.接著統計各島的調查地點數。複製貼上之前的島資料到一個新欄位，在這裡用countif函數統計地點數量。統計出來趨勢一樣，但是略有不同。可以用sum來檢視資料計算是否有錯誤。

五、日期統計
1.計算各年度的調查記錄
調查日期統計通常跟地點有關，不同資料來源會呈現不同趨勢。例如:公民科學的資料容易呈現重複調查並且通常是離城市近易達性高的景點；生物資源調查則會呈現地點廣泛，注重不同環境或地理區隔的分群取樣。
步驟:開新的日期統計表單，複製貼上調查日期，移除重複，依照年度進行統計。除了2004、2005年特別多，沒有資料偏好。
使用countifs區間計算函數:
=COUNTIFS(B$2:B$56, ">="&DATE(E2,1,1),B$2:B$56,"<="&DATE(E2,12,31))
2.月份統計。使用text先抓出資料的月份，再用countif統計各月份數量。(年月有0的會跑掉。目前無法排除問題。)除了5月沒有特定月份偏好。

以調查報告書的寫法:
日本國立琉球大學的線上標本資料庫蝸牛為針對各分類群的系統性收藏，記錄時間從1988年2016年，共收錄22科114種119份乾燥貝殼標本。採集範圍涵蓋琉球群島之奄美大島至與那國島，22座大小島嶼55個採集地點。每個地點至多記錄到8個物種。記錄筆數與物種最多的科依序為扁蝸牛科、南亞蝸牛科、煙管蝸牛科、山蝸牛科等，其中包含5個外來種，除雙色草包蝸牛外，皆為農業或人工環境常見的世界性外來物種，包含:非洲大蝸牛、雙色草包蝸牛、高音福絲鼈甲蝸牛、扁蝸牛、錐蝸牛屬。資料庫未收錄蛞蝓類物種。記錄地點沖繩縣98筆、鹿兒島縣21筆，記錄最多的島依序為:沖繩島50筆22個地點、宮古島16筆7個地點、奄美大島12筆2個地點、石垣島10筆8個地點、西表島7筆資料4個地點。記錄年份除2004、2005年資料較多，其他年份資料皆少。調查月份則以5月最多，與蝸牛在溫暖季活動的特性無明顯相關。